Magyarországon a határon átnyúló együttműködésnek jelentős múltja van, mivel már az uniós csatlakozás előtt is aktívan részt vettünk a Phare források által támogatott határon átnyúló fejlesztésekben. Jelenleg mind a hét határszakaszunkon működik határon átnyúló együttműködési program, ezek közül négy esetben Magyarország látja el a programirányító funkciókat. Ezek az együttműködések a közvetlenül felhasználható forrásokon kívül Magyarország számára azért is alapvető fontosságúak, mert a 19 NUTS III szintű megye közül 15 vesz részt CBC programban. Magyarország lakosságának több, mint 80 %-a él határral is érintkező régiókban miközben az EU teljes népességének csupán egy kicsivel több, mint harmada lakik országhatárral is érintkező térségekben.
